Cerca de três quartos da sua obra remanescente ocupam-se da interpretação das Escrituras. Foi como comentador do texto bíblico que ele mais influencou a literatura grega e latina dos primeiros séculos do Cristianismo, nomeadamente a literatura cristã.
Mas foi como filósofo e pensador das coisas divinas e humanas que ele mais se evidenciou na expressão das suas ideias, se bem que, na maior parte dos casos, pela via da exegese bíblica. O texto bíblico que serviu de base para os seus comentários foi a Septuaginta, versão grega dos Setenta (LXX) produzida cerca de 250 anos antes dele; comentários que especialmente se centraram no Pentateuco (os primeiros cinco livros da Bíblia hebraica).